※このプラグインを使わなくても同等の機能がDocuWorksに標準で搭載されているようです。コメントにてご意見をいただきました。
ご提供いただいた方ありがとうございました。
DocuWorksには「マーカー」というツールがあります。
アノテーションでなぞった部分を蛍光マーカーで印をつけたような効果になります。
同じ単語を一気にマーキングしたい場合にはDocuWorksの標準プラグインにその機能があります。
「検索してマーク」プラグインです。
このプラグインは細かな設定ができるのですが、ちょっと面倒な点があります
- マーカーの色などを記憶してくれない。
- 付箋の設定も記憶してくれないので、毎回マーキングされたページに付箋が付いてしまう。(オフにしても次回開いたときにまたオンになっている)
そういうひと手間が面倒だな、と感じたらこのかんたん検索単語マーキングプラグイン for DocuWorks(R)をご使用ください。

マーカーの色、大文字小文字の区別の設定などはしっかり記憶します。
単語を指定してOKを押すだけのカンタン操作。
変換前

変換後

ちなみにこのマーキングですが、黒(透明なし)で実行すると文字をスミで消したようにできます。

会社名や電話番号を伏せたいときなどに使うと便利です。
(ただ、OCRやテキストの状態によっては文字が完全に隠れませんので十分注意してください)

「検索してマーク」プラグインでも、
「プラグイン」→「設定」からマーカーの色や付箋のありなしを
設定すれば、記憶してくれますよ。
しかも2個以上登録して、それぞれ別の設定を記憶できます。
そんな機能があったんですね!?
し、知らなかった・・・
無駄にプラグインにしてしまいました。
また隠された機能がありましたら教えてください。